Matlab y SPM en Ubuntu
Ahora en Septiembre empiezo un contrato de investigación con la Universidad de Granada. El trabajo consiste en implementar una herramienta de procesamiento y visualización de datos fMRI integrando diferentes tipos de software, incluyendo SPM, Matlab e igraph.
Lo primero es instalar Matlab. Yo en concreto voy a utilizar la versión R2009b y el desarrollo lo voy a realizar bajo Ubuntu 10.04. La instalación de Matlab resulta bastante sencilla de lo que imaginaba, para ello he seguido esta guía.
Lo siguiente ha sido descargar SPM, más concretamente la versión SPM8 y su correspondiente actualización. Este paquete software está liberado bajo licencia GPL, pero es necesario registrarse para poder descargarlo.
Lo siguiente es descomprimirlo y añadir la actualización:
unzip spm8.zip
unzip -o spm8_updates_rxxxx.zip -d spm8
Yo tengo Matlab instalado en la ruta /usr/local/matlabR2009b/, y para tener todo centralizado, voy a mover SPM al mismo directorio. Además, para poder modificar las preferencias de los ToolBox utilizados en Matlab he dado permisos de escritura a cualquier usuario (no me supone un riesgo de seguridad :)
sudo mv spm8 /usr/local/matlabR2009b/
sudo chmod -R o+w /usr/local/matlabR2009b/toolbox/local/
Y por último, añadir el ToolBox a Matlab. Para ello, File > Set Path > Add Folder... y seleccionamos /usr/local/matlabR2009b/spm8/.
Con esto todo está listo.
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La teoría es cuando crees saber algo, pero no funciona.
La práctica es cuando algo funciona, pero no sabes por qué.
Los programadores combinan la teoría y la práctica:
Nada funciona y no saben por qué.
